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使用PCR儀進行基因擴增的實驗方法

更新時間:2023-09-12點擊次數:1618

實驗室常用 DNA 聚合酶有三種:TaqTM , EXTaqTM  和  Pyrobest TM DNA Polymerase。TaqTM 是一般的 DNA 聚合酶, 保真性較差 , 但價錢便宜, 一般用于基因表達的檢測等。TaKaRa EXTaqTM 是具有 Proofreading  活性的耐熱性 DNA 聚合酶, 具有一定的保真性, 而且其擴增得到的 PCR 產物 3 ’ 端附有一個 “A" 堿基 ,如果希望直接將產物克隆 到 T-vector 可以用此酶 。 Pyrobest TM DNA Polymerase 也是具有 Proofreading 活性的耐熱性 DNA 聚合酶, 其特點是保真性高,擴增得到的 PCR 產物為平滑末端。如果進行基因的擴增請使用此酶。


1.   按下列組成在 PCR 反應管中調制反應液:


TaKaRa TaqTM  TaKaRa EXTaqTM 的配方

 

Reagent

Quantity, for 50µl of reaction mixture

10X PCR buffer Mg2+  free

5 µ l

 

MgCl225mM

 TaKaRa TaqTM  3 µl

 TaKaRa EXTaqTM  4 µl

2.5mM dNTP mix

4 µ l

10µM Primer  上游

1 µ l

10µM Primer 下游

1 µ l

Template DNA

1 µ l

Taq  EXTaqDNA Polymerase

0.25 µl

Sterile deionized water

Up to 50µl

Total

50 µl /Sample

merase 的配方

 

Reagent

Quantity, for 50µl of reaction mixture

10X Pyrobest buffer

 l

2.5mM dNTP mix

 l

10µM Primer 上游

 l

10µM Primer  下游

 l

Template DNA

 l

Pyrobest TM DNA Polymerase

0.25µl

Sterile deionized water

Up to 50µl

Total

50µl /Sample

 



① 反應總體積根據實際情況進行調控,可以做 20~50µl 以節約試劑;

② 將上表各成分加入到 0.2ml 或 0.5ml 滅菌的 PCR 薄壁管中;


③ 如果不用 PCR 儀的加熱蓋,在反應混合液的上層加 30 ~50µl  的礦物油防止樣品在 PCR 的過程中蒸發;


2.   按以下程序進行 PCR 擴增。

PCR 反應條件視模板、引物等的結構條件不同而各異, 在實際操作中需根據具體的情況以及 PCR 結果而進行優化。

 

 

Step

Temperature,

° C

 

Time, min

Number of

cycles

Note

起始變

 

94~95

 

1-3

 

1


變性

94~95

0.5-2

 

 

 

 

25-35

退火溫度比理論退火 溫度大概低 C ,再

根據反應結果優化

 

退火

 

37-70

 

0.5-2

 

延伸

 

70-75

根據擴 增產物

的大小

每分鐘延伸 1000bp

最終延

 

70-75

 

10

 

1


 




反應結束后,抽取擴增樣品 5µl,用瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結果,用 DNA marker 判斷擴增片段的大小或冷凍保存,以備以后分析使用。

          蘇州阿爾法生物是一家專業從事實驗室設備和耗材銷售的公司,為科研機構、醫院、生物制藥公司和生物科技企業等提供一站式的實驗室解決方案。作為阿爾法生物的供應商之一,朗基PCR儀系列涵蓋了熒光定量PCR儀、快速PCR儀、高通量PCR儀和梯度PCR儀、朗基 Q2000B 等多個型號,滿足不同實驗需求。更多的 PCR實驗 設備報價和實驗耗材采購服務請進入蘇州阿爾法生物實驗器材有限公司我們將為您提供滿意的實驗室解決方案。

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